化学进化反映了物质从低级向高级的历史发展，反应物作为“过去”，生成物作为“现在”或“未来”，这里不仅有复杂的质变，而且还记录了时间的进程。因而，化学进化的方向反映了时间的方向。对于不可逆的化学反应过程来说，虽然化学过程的方向就是时间之矢的方向，但是没有能反映出化学物质的进化方向。只有在化学进化过程中，时间的进化方向才与化学物质的进化方向一致。化学进化过程中的时间，已成为物质进化的“内部量度”。耗散结构理论的“内部时间”概念，为化学进化的时间方向提供了科学的描述（见第一节）。依照化学中时间概念的特点不同，可以看出，化学反应存在着不可逆的化学反应（时间具有不可逆性）；平衡态的化学反应（与时间无关）；远离平衡态时含有催化机制的不可逆化学反应，可以形成化学振荡结构（时间与生物反应联系起来）；以及化学进化过程中的反应（时间是物质进化的内部量度）。这就有力地揭示了普里戈金提出的时间在三个层次上（即与运动相联系的可逆时间，与热力学相联系的不可逆时间，与物质进化相联系的时间）的联系和转化。化学是介于物理和生物学之间的中间学科，就某种意义上说，化学中的时间概念实现了物理学、化学和生物学的一体化。这也将实现恩格斯预想的计划，即物理学家，化学家和生物学家共同努力来详细研究从非生命界向生命界跃进和绘出一个统一的世界画面。