1908年11月14日，清政府突然宣布光绪皇帝载 于当日酉刻“崩于瀛台之涵元殿”。时隔不到20个小时，慈禧皇太后那拉氏也于次日未刻“崩于中南海之仪鸾殿”。对 38岁的光绪竟死于慈禧之前，历来众说纷法，成为一桩悬而未决的历史疑案。有关光绪的死因，大致有以下几种说法：
     一种说法认为，慈禧太后病危时，深怕自己死后，被她废黜的光绪重新当政，继续推行维新变法，所以指使太监下毒手把光绪帝害死。以绝后患。如《清室外记》中曾谓“皇帝宾天之情形及其得病之由，外人无由详知，惟藏于李莲英辈之心中。”认为光绪帝很可能是被李莲英谋害致死的。以上的记载是市井传闻，不足为信，但当时尚有一些接近宫禁、颇知内情之人，甚至有自称亲见亲闻者，后来亦撰文著书，认为光绪帝之死，值得怀疑。
     例如曾任19年御史及起居注官、较为接近光绪帝的恽毓鼎，在所撰的《崇陵传信录》中写道：西太后病重时，有人告诉她，说光绪帝很高兴，于是慈禧大怒曰：“我不能先尔死”，光绪遂死。清朝末年曾在宫中担任过两年女官的德龄女士，在所著的《瀛台泣血记》一书中，更十分肯定是“万恶的李劳英眼看太后寿命已经不久，自己的靠山快要发生问题了，便暗自着急起来。”据德龄的记载，光绪帝之死，系李莲英下毒手所致。更有一位曾给光绪皇帝治过病的名医叫屈桂庭的，于所撰《诊治光绪皇帝秘记》一文（载《逸经》第二十九期）中说，当他在光绪帝死去的前三天再次去医病时，发现光绪帝突然腹部剧痛，他认为“此系与前病绝少关系”。
     另一种说法，则认定光绪帝是被袁世凯进药毒死的。因为戊戌变法时，由于袁世凯的告密，慈禧才镇压了维新运动。袁世凯怕慈禧死后光绪重新执政，遂先与庆亲王奕?勾结，准备废光绪立奕劻之子，事不成，乃下此毒手。溥仪在《我的前半生》一书中就十分明确地谈到这一点，说：“我还听见一个叫李长安的老太监说起光绪之死的疑案。照他说。光绪在死的前一天还是好好的，只是因为用了一剂药就坏了，后来才知道这剂药是袁世凯使人送来的……据内务府某大臣的一位后人告诉我：光绪死前不过是一般的感冒，他看过那些药方，脉象极为平常，加之有人前一天还看到他象好人一样……病重消息传出不过两个时辰，就听说已经‘晏驾’了。